RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CD302Q8IX05 232 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 GPD1LQ8N335 351 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 TIGD1Q96MW7 591 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 UROC1Q96N76 676 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KLHL5Q96PQ7 755 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 COG5Q9UP83 839 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 PLXNA3P51805 1871 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO7AQ13402 2215 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF233A6NK53 670 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BQ06 376 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 PODXLO00592 558 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAPPC3O43617 180 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 EXTL3O43909 919 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KINO60870 393 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 LILRB3O75022 631 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 RHOBTB3O94955 611 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 IL18RAPO95256 599 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SMC2O95347 1197 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 EFEMP2O95967 443 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 URODP06132 367 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 NFICP08651 508 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA31D3P0C874 917 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 GLUD2P49448 558 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFV1P49821 464 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNQ1P51787 676 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 WNT7BP56706 349 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP6Q16828 381 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA1Q5VX52 437 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 PALB2Q86YC2 1186 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 EFHBQ8N7U6 833 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 BEST2Q8NFU1 509 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SMARCE1Q969G3 411 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 APOL5Q9BWW9 433 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 ASB7Q9H672 318 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE11AQ9HCR9 933 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CHST7Q9NS84 486 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 DPP3Q9NY33 737 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 THEGQ9P2T0 379 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 STK39Q9UEW8 545 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 VWA8A3KMH1 1905 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE4BO95155 1302 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 PPEF2O14830 753 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 EPCAMP16422 314 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP3A5P20815 502 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 MCM4P33991 863 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2HP62256 183 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 DSG1Q02413 1049 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNB1Q14721 858 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPN14Q15678 1187 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMK4Q16566 473 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 AAK1Q2M2I8 961 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 RTP2Q5QGT7 225 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CBWD2Q8IUF1 395 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-211ENST00000588374 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms