RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TUSC3Q13454 348 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DUOXA2Q1HG44 320 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FIBCD1Q8N539 461 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF516Q92618 1163 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RABGGTAQ92696 567 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC35C1Q96A29 364 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CWH43Q9H720 699 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DPP3Q9NY33 737 aa16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ATP1A3P13637 1013 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PBX3P40426 434 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ENPEPQ07075 957 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BIRC3Q13489 604 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa16.96■□□□□ 0.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STX10O60499 249 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ITGB3P05106 788 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CA3P07451 260 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KRT19P08727 400 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CYP3A5P20815 502 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 OR1G1P47890 313 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AP3M2P53677 418 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KRT31Q15323 416 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAN2A1Q16706 1144 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SCARA3Q6AZY7 606 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PBX4Q9BYU1 374 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RBSNQ9H1K0 784 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CHD7Q9P2D1 2997 aa16.95■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LINC01553A4QN01 128 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PPEF2O14830 753 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PHACTR2O75167 634 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARHGEF15O94989 841 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GTF2H1P32780 548 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC11A1P49279 550 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MXI1P50539 228 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CLCNKBP51801 687 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BCAR1P56945 870 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KCNH2Q12809 1159 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CBWD6Q4V339 395 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SV2AQ7L0J3 742 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UROC1Q96N76 676 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SIX4Q9UIU6 781 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MSRAQ9UJ68 235 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.94■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 F8W810 466 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PODXLO00592 558 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NRP1O14786 923 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GALTP07902 379 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LAG3P18627 525 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRPAP1P30533 357 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FMO5P49326 533 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MYL7Q01449 175 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RAB30Q15771 203 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UPP1Q16831 310 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZACNQ401N2 412 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 VWA3BQ502W6 1294 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MIIPQ5JXC2 388 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KRT39Q6A163 491 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HASPINQ8TF76 798 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF558Q96NG5 402 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 VPS16Q9H269 839 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.93■□□□□ 0.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms