RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 IKZF4Q9H2S9 585 aa12.96□□□□□ -0.33
GGA3-217ENST00000583667 FZD8Q9H461 694 aa12.96□□□□□ -0.33
GGA3-217ENST00000583667 DLL3Q9NYJ7 618 aa12.96□□□□□ -0.33
GGA3-217ENST00000583667 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
GGA3-217ENST00000583667 MYO6Q9UM54 1294 aa12.96□□□□□ -0.33
GGA3-217ENST00000583667 PLAGL2Q9UPG8 496 aa12.96□□□□□ -0.33
GGA3-217ENST00000583667 PES1O00541 588 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 CCP110O43303 1012 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 LDHAP00338 332 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 TUBB4AP04350 444 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 KRT13P13646 458 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 KLRC1P26715 233 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 TMOD1P28289 359 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 GTF2H1P32780 548 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 CYP2J2P51589 502 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 PTENP60484 403 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 CLDN10P78369 228 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 FAM187BQ17R55 369 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 EFCAB12Q6NXP0 572 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 GBP6Q6ZN66 633 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 TOP1MTQ969P6 601 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 KIFC3Q9BVG8 833 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 CEP72Q9P209 647 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 FRYLO94915 3013 aa12.95□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 NRCAMQ92823 1304 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 A0A0B4J269 797 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 LRRIQ4A6NIV6 560 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 C5orf67F2Z3F1 127 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 ACKR2O00590 384 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 EXTL3O43909 919 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 NOL4O94818 638 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 FMO5P49326 533 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 ADAM17P78536 824 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 DRP2Q13474 957 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 EXOC3L4Q17RC7 722 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 MARCH8Q5T0T0 291 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 MTHFD1LQ6UB35 978 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 CYP26C1Q6V0L0 522 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 USP37Q86T82 979 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 SESTD1Q86VW0 696 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 GPD1LQ8N335 351 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 NEK11Q8NG66 645 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 CPLX3Q8WVH0 158 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 BAP1Q92560 729 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 KAT2BQ92831 832 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 MMRN2Q9H8L6 949 aa12.94□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 UPP2O95045 317 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 RB1P06400 928 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 PON1P27169 355 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 HOXC8P31273 242 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 CTNNB1P35222 781 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 BMPR1AP36894 532 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 LIG4P49917 911 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 VAMP7P51809 220 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 PPFIA1Q13136 1202 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.341e-10■□□□□ 8.9
GGA3-217ENST00000583667 GRIK4Q16099 956 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 MAPK6Q16659 721 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 C1orf220Q5T0J3 134 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 ZNF618Q5T7W0 954 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 WDR59Q6PJI9 974 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 CCDC170Q8IYT3 715 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 PARD3BQ8TEW8 1205 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 POMGNT1Q8WZA1 660 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 KATNAL1Q9BW62 490 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 GANQ9H2C0 597 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 COQ4Q9Y3A0 265 aa12.93□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 ZNF233A6NK53 670 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 TISP43B9A030 160 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 ZSCAN12O43309 604 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 TOM1L1O75674 476 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 LINC00271P0C7V0 271 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 ZNF286BP0CG31 522 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 RFX1P22670 979 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 PROZP22891 400 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 KLK7P49862 253 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 GOLGA8FQ08AF8 430 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa12.92□□□□□ -0.34
GGA3-217ENST00000583667 CETN1Q12798 172 aa12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms