RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD14O00487 310 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ELMOD1Q8N336 334 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF560Q96MR9 790 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TBCCQ15814 346 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM60Q495X7 471 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SPON2Q9BUD6 331 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TPI1P60174 286 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 MCEEQ96PE7 176 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TSPOAP1O95153 1857 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ASIC4Q96FT7 647 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 NEMP1O14524 444 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 MYO1DO94832 1006 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ACOT2P49753 483 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CDK17Q00537 523 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQJ5 194 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CDH16O75309 829 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB4P48594 390 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 MED21Q13503 144 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf72Q96LT7 481 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 GYPCP04921 128 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF543Q08ER8 600 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 LZICQ8WZA0 190 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB10P48595 397 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF235Q14590 738 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 RMDN1Q96DB5 314 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 APRTP07741 180 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.43■■□□□ 1.183e-7■■■■□ 25
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CCND1P24385 295 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 STX3Q13277 289 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 JAMLQ86YT9 394 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZIM3Q96PE6 472 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB3P29508 390 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 AGAP3Q96P47 875 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ANGPT2O15123 496 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CNGA3Q16281 694 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TNIP3Q96KP6 325 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 EPAS1Q99814 870 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 FDX1P10109 184 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM143Q96AN5 459 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 FLT1P17948 1338 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SLC9A1P19634 815 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ANTXR2P58335 489 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SP8Q8IXZ3 490 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 RGS7P49802 495 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 STAT5BP51692 787 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 INPP5AQ14642 412 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ALKQ9UM73 1620 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 LSP1P33241 339 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 HSD17B4P51659 736 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ACCSLQ4AC99 568 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
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