RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	DPP3	Q9NY33	737 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	POMC	P01189	267 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	LRPAP1	P30533	357 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	GCLM	P48507	274 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	RBP5	P82980	135 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	DSC1	Q08554	894 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	NAB2	Q15742	525 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	SARM1	Q6SZW1	724 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	LRRC43	Q8N309	656 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	DEFB123	Q8N688	67 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	YME1L1	Q96TA2	773 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	VPS16	Q9H269	839 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
TBCD-223	ENST00000576691		A0A1B0GTH6	734 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	LGALS16	A8MUM7	142 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	PHACTR2	O75167	634 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	TPM3	P06753	285 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	MXI1	P50539	228 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	UBASH3A	P57075	661 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	PTPRJ	Q12913	1337 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		18.14	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	ANO9	A1A5B4	782 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	CBFA2T2	O43439	604 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	ALDH2	P05091	517 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	ATIC	P31939	592 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	PNPLA4	P41247	253 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	BIRC3	Q13489	604 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	TRPC3	Q13507	836 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	NR1I3	Q14994	352 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	CBWD6	Q4V339	395 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	TAF4B	Q92750	862 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	ANK1	P16157	1881 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	FSD2	A1L4K1	749 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	PIR	O00625	290 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	TLL1	O43897	1013 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	GATM	P50440	423 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	MYL7	Q01449	175 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	NCOA4	Q13772	614 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	UPP1	Q16831	310 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	GBP6	Q6ZN66	633 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	CXorf38	Q8TB03	319 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	RAB20	Q9NX57	234 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		18.12	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	DDHD2	O94830	711 aa		18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	ITGB3	P05106	788 aa		18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	UBXN1	Q04323	297 aa		18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	MYO1E	Q12965	1108 aa		18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	GSE1	Q14687	1217 aa		18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	FIBCD1	Q8N539	461 aa		18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		18.11	■□□□□ 0.49
TBCD-223	ENST00000576691	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		18.11	■□□□□ 0.49

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