RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2CD2Q9Y426 696 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 EFEMP2O95967 443 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP3A5P20815 502 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 CASP4P49662 377 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 BEST2Q8NFU1 509 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 B3GALT6Q96L58 329 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBP1Q9H171 429 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 HIDE1A8MVS5 230 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CA8P35219 290 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CENPPQ6IPU0 288 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.7■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CXCL14O95715 111 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOD2P04179 222 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 NR2F2P24468 414 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRPAP1P30533 357 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP24A1Q07973 514 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 STIM1Q13586 685 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP135Q66GS9 1140 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPP3Q9NY33 737 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.222e-11■■■■■ 137.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 I3L4J1 428 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPEF2O14830 753 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 MBD3O95983 291 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTSAP10619 480 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRCC3P46736 316 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYBPC2Q14324 1141 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK39Q9UEW8 545 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPRJQ12913 1337 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 VWA8A3KMH1 1905 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2CD2LO14523 706 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMA7O14818 248 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAM9Q13443 819 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMD6Q15008 389 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFIL3Q16649 462 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCN1AP35498 2009 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PER2O15055 1255 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 SURF1Q15526 300 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP41Q3LFD5 358 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP57Q86XR8 500 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSG101Q99816 390 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGFLR1Q9H665 355 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.67■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 URODP06132 367 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCNE1P24864 410 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 NRIP1P48552 1158 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLUD2P49448 558 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPN14Q15678 1187 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 FNBP1Q96RU3 617 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 TLE6Q9H808 572 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms