RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT72	Q14CN4	511 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	DHCR24	Q15392	516 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	C14orf80	Q86SX3	495 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	AHI1	Q8N157	1196 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PR48	441 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ANO9	A1A5B4	782 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS38	A1L453	326 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP69	A5D8W1	941 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SPDEF	O95238	335 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PHKG2	P15735	406 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CASR	P41180	1078 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TERF2	Q15554	542 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR91	A4D1P6	747 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MGST3	O14880	152 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR39	O43194	453 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	KATNA1	O75449	491 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ABLIM3	O94929	683 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CASP2	P42575	452 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LSS	P48449	732 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR15	P49685	360 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ITK	Q08881	620 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MTMR1	Q13613	665 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MLC1	Q15049	377 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF280D	Q6N043	979 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	KSR2	Q6VAB6	950 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX19	Q8NA77	164 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	GAB3	Q8WWW8	586 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	FERMT2	Q96AC1	680 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB9	Q96C00	473 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SARG	Q9BW04	601 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX101	Q9BY14	249 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	EPC1	Q9H2F5	836 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	USP18	Q9UMW8	372 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LZTS1	Q9Y250	596 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	NPHP1	O15259	732 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MYL3	P08590	195 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA31D3	P0C874	917 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGAM	P11215	1152 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	FDXR	P22570	491 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LSP1	P33241	339 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAPPC10	P48553	1259 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PROK1	P58294	105 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	NHLH2	Q02577	135 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SCAP	Q12770	1279 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PICALM	Q13492	652 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ERAP2	Q6P179	960 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		3.47	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		3.47	□□□□□ -1.85

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