RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	ADRM1	Q16186	407 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF425	Q6IV72	752 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	APPBP2	Q92624	585 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	DPF1	Q92782	380 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	DRC1	Q96MC2	740 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	MYOC	Q99972	504 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	FANCL	Q9NW38	375 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	SCOC	Q9UIL1	159 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	ORC4	O43929	436 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	CELA2A	P08217	269 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	NOMO3	P69849	1222 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	NOMO1	Q15155	1222 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	HASPIN	Q8TF76	798 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	MFSD3	Q96ES6	412 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	PNKP	Q96T60	521 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	FEZ1	Q99689	392 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	YY2	O15391	372 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	FATE1	Q969F0	183 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	MED15	Q96RN5	788 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	GREM2	Q9H772	168 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC151	A5D8V7	595 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	IKBKB	O14920	756 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	TEX33	O43247	280 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	ALAS1	P13196	640 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	BPI	P17213	487 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	PCSK1	P29120	753 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	SESN3	P58005	492 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	PPP3CA	Q08209	521 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	SLFN5	Q08AF3	891 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	MUM1	Q2TAK8	710 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	VWA1	Q6PCB0	445 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	FITM2	Q8N6M3	262 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843		Q8NA96	180 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	UBXN4	Q92575	508 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	PIF1	Q9H611	641 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	PLAA	Q9Y263	795 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COPS2-205	ENST00000558843	MPPED1	O15442	326 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	FCER1A	P12319	257 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ITPKB	P27987	946 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	GRIA3	P42263	894 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	KAZN	Q674X7	775 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	PDPR	Q8NCN5	879 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	TFAP2B	Q92481	460 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	USP7	Q93009	1102 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ULK1	O75385	1050 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	GPR32	O75388	356 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ENDOD1	O94919	500 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	PRKCG	P05129	697 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ELFN1	P0C7U0	828 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	SRGN	P10124	158 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ID4	P47928	161 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	FBXL20	Q96IG2	436 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	NEMP1	O14524	444 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	PROM1	O43490	865 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	CDC45	O75419	566 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	SLC6A9	P48067	706 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	MTM1	Q13496	603 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	SEPT2	Q15019	361 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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