RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	ELMOD1	Q8N336	334 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	E2F7	Q96AV8	911 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	MSANTD3	Q96H12	275 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	NACC1	Q96RE7	527 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	GPR88	Q9GZN0	384 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	BRD9	Q9H8M2	597 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PRRG1	O14668	218 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SLC30A4	O14863	429 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SYN3	O14994	580 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	NEMF	O60524	1076 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	KRT37	O76014	449 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PRKCB	P05771	671 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ADRB1	P08588	477 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TDGF1	P13385	188 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PSMC3	P17980	439 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CYP11B2	P19099	503 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MUT	P22033	750 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MCM7	P33993	719 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TXK	P42681	527 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	NAMPT	P43490	491 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CXCL12	P48061	93 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CLCNKB	P51801	687 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZNF174	Q15697	407 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	UPP1	Q16831	310 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TPGS2	Q68CL5	300 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TSSK4	Q6SA08	328 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ERMN	Q8TAM6	284 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ING5	Q8WYH8	240 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	FAM3C	Q92520	227 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	IFT74	Q96LB3	600 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MTMR9	Q96QG7	549 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CACNA1A	O00555	2505 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TRIO	O75962	3097 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	USP34	Q70CQ2	3546 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SHISA7	A6NL88	538 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZNF263	O14978	683 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SYT1	P21579	422 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ROR1	Q01973	937 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	LRRC32	Q14392	662 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CSRP2	Q16527	193 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ST3GAL2	Q16842	350 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	XKR4	Q5GH76	650 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TTC38	Q5R3I4	469 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PADI6	Q6TGC4	694 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	KIFAP3	Q92845	792 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SMARCD2	Q92925	531 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CORO1B	Q9BR76	489 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		7.51	□□□□□ -1.21

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