RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SFI1A8K8P3 1242 aa8.95□□□□□ -0.98
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PTPRB-208ENST00000550358 HDAC4P56524 1084 aa8.95□□□□□ -0.98
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PTPRB-208ENST00000550358 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.95□□□□□ -0.98
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PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2ADP20671 130 aa8.95□□□□□ -0.98
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PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa8.95□□□□□ -0.98
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 RAPGEF5Q92565 580 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
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