RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINB9P50453 376 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 STAT4Q14765 748 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GPRASP2Q96D09 838 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MUC3BQ9H195 1237 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 COG4Q9H9E3 785 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CITO14578 2027 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 E9PMD0 336 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GYG2O15488 501 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 LRG1P02750 347 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ICAM1P05362 532 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 AP2B1P63010 937 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 AMPD2Q01433 879 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NCLNQ969V3 563 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SAAL1Q96ER3 474 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CEP19Q96LK0 163 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SPAG7O75391 227 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 BFSP2Q13515 415 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CASP8Q14790 479 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 KRT82Q9NSB4 513 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PLAAQ9Y263 795 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FAM170AA1A519 330 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 KRT14P02533 472 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CYP2C8P10632 490 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GRIN1Q05586 938 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SYTL3Q4VX76 610 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GGA3Q9NZ52 723 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 INTUQ9ULD6 942 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SYCE1LA8MT33 242 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 KCNN4O15554 427 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 E2F6O75461 281 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FAM200BP0CF97 657 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MAP2K2P36507 400 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FMO5P49326 533 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EMC2Q15006 297 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ERO1BQ86YB8 467 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TEKT4Q8WW24 435 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TTC17Q96AE7 1141 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SPON2Q9BUD6 331 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MTFR1LQ9H019 292 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MCF2P10911 925 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PDK1Q15118 436 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EXT2Q93063 718 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 WDR91A4D1P6 747 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZW10O43264 779 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFS3O75489 264 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HIST1H2ADP20671 130 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RASIP1Q5U651 963 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 OPTNQ96CV9 577 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.73□□□□□ -1.33
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