RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	C3orf20	Q8ND61	904 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	IL31RA	Q8NI17	732 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR48	Q8TAF3	677 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308		Q8TCH9	128 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1191	Q96A73	305 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CRB3	Q9BUF7	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MAF1	Q9H063	256 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	LUZP4	Q9P127	313 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	USP19	O94966	1318 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	RPTOR	Q8N122	1335 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SH3BP5	O60239	455 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	GAA	P10253	952 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	FGL2	Q14314	439 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MST1L	Q2TV78	715 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	DPP9	Q86TI2	863 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX33	Q8WV41	574 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	NUDT11	Q96G61	164 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC35A4	Q96G79	324 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308		H3BUI4	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MYO1F	O00160	1098 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL18	O94889	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	AMY1A	P04745	511 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TYR	P14679	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCB4	P21439	1286 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM14	Q14142	442 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	RALBP1	Q15311	655 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CUX1	P39880	1505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308		F8W8V4	182 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	WNT10B	O00744	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ENDOD1	O94919	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	KNG1	P01042	644 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	CHGB	P05060	677 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	KIT	P10721	976 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG1-222	ENST00000545308	ECHS1	P30084	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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