RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FZD8Q9H461 694 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0B4J269 797 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ABLIM1O14639 778 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MYL3P08590 195 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MYBL2P10244 700 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CHRNB2P17787 502 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ACOT2P49753 483 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 GCNT1Q02742 428 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TFDP1Q14186 410 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TCEAL1Q15170 157 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPROQ16827 1216 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ZPBP2Q6X784 338 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 AKT3Q9Y243 479 aa21.75■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A087WZ62 844 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFRSF8P28908 595 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PSEN2P49810 448 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM193AP78312 1265 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 GPC5P78333 572 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MFSD10Q14728 455 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPK6Q16659 721 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM84AQ96KN4 292 aa21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.072e-9■□□□□ 9.1
PACSIN3-211ENST00000539589 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 B4GALT5O43286 388 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP11B1P15538 503 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TNNI1P19237 187 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE6CP51160 858 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF3Q5VWG9 929 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 IFT20Q8IY31 132 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TATDN2Q93075 761 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT12Q99456 494 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 HINFPQ9BQA5 517 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM189A1O60320 539 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ELNP15502 786 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP2K2P36507 400 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 SEZ6Q53EL9 994 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR44Q5JSH3 913 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF516Q92618 1163 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 H3BQF6 201 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ACKR2O00590 384 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAM17P78536 824 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CDR2Q01850 454 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 POU5F1BQ06416 359 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ZACNQ401N2 412 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 RASGEF1CQ8N431 466 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ANK1P16157 1881 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TOM1L1O75674 476 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PROZP22891 400 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TMOD1P28289 359 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 GJA9P57773 515 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FMO1Q01740 532 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 AMHR2Q16671 573 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB33Q86T24 672 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 COG5Q9UP83 839 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 NRCAMQ92823 1304 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CLDN3O15551 220 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MMEP08473 750 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT5P13647 590 aa21.71■■□□□ 1.07
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