RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	CEP72	Q9P209	647 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	B3GAT3	O94766	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	FGD1	P98174	961 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TFDP1	Q14186	410 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	POTED	Q86YR6	584 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TTC8	Q8TAM2	541 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	EXTL3	O43909	919 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	CNR2	P34972	360 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	EVC	P57679	992 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	UPP1	Q16831	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	KBTBD6	Q86V97	674 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TCEAL3	Q969E4	200 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF263	O14978	683 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	MICAL2	O94851	1124 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	LYPLA2	O95372	231 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ATF2	P15336	505 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	RARRES1	P49788	294 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ARPP19	P56211	112 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	KRT32	Q14532	448 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TEAD2	Q15562	447 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	CEP68	Q76N32	757 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	WNT7A	O00755	349 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PRRG1	O14668	218 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	DGAT1	O75907	488 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	EPN2	O95208	641 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	VNN2	O95498	520 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	LRG1	P02750	347 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PRKCB	P05771	671 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	HOXA6	P31267	233 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ACAP1	Q15027	740 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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