RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532181.5

SSH3-208, Transcript of slingshot protein phosphatase 3, human

TSL 3

Gene SSH3, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSH3-208	ENST00000532181	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSH3-208	ENST00000532181	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	EXTL3	O43909	919 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ABCD1	P33897	745 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	BRCC3	P46736	316 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	KRT17	Q04695	432 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PSMD2	Q13200	908 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ANK1	P16157	1881 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	C5orf42	Q9H799	3197 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CXCL14	O95715	111 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PPM1A	P35813	382 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PRCP	P42785	496 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CASP4	P49662	377 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CYP2J2	P51589	502 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	KCNC3	Q14003	757 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CAMK4	Q16566	473 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	UBE4B	O95155	1302 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CIT	O14578	2027 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PODXL	O00592	558 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	SPTLC1	O15269	473 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CTSA	P10619	480 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ZNF516	Q92618	1163 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	BIN1	O00499	593 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	C2CD2L	O14523	706 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ADAM12	O43184	909 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	TADA2A	O75478	443 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	B3GAT3	O94766	335 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	SOD2	P04179	222 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	LRPAP1	P30533	357 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSH3-208	ENST00000532181	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.36	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms