RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529172.1

PPP6R3-216, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 2

Gene PPP6R3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-216	ENST00000529172	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MYO1F	O00160	1098 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	F2RL2	O00254	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	RAP2A	P10114	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	NPR1	P16066	1061 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PI3	P19957	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PRDX5	P30044	214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CASR	P41180	1078 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	KCNJ5	P48544	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	FMO1	Q01740	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	TBX3	O15119	743 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	NPHP1	O15259	732 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	NCK2	O43639	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	NBN	O60934	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	IL18RAP	O95256	599 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	AHSG	P02765	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	GNAI3	P08754	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ABCB4	P21439	1286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PPM1A	P35813	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	HAL	P42357	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ADCY7	P51828	1080 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	NPEPPS	P55786	919 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	GNAI1	P63096	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	APBA1	Q02410	837 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PTH1R	Q03431	593 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	DAG1	Q14118	895 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	TRIM14	Q14142	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ACAP1	Q15027	740 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	APOL1	O14791	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	GRM6	O15303	877 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SUV39H1	O43463	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ATP5J	P18859	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	FLT3LG	P49771	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	GZMK	P49863	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MAPK10	P53779	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SOX8	P57073	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPP6R3-216	ENST00000529172	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms