RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528145.5

ATG13-210, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 3

Gene ATG13, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-210ENST00000528145 PAK1Q13153 545 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 PSMD6Q15008 389 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 SPATA1Q5VX52 437 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 TTI2Q6NXR4 508 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 TSG101Q99816 390 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 LZTS1Q9Y250 596 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 VWA8A3KMH1 1905 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 PPEF2O14830 753 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 EFEMP2O95967 443 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 FOSL2P15408 326 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 CYP3A5P20815 502 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 LRPAP1P30533 357 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 NLRP12P59046 1061 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 KRT17Q04695 432 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 FUT10Q6P4F1 479 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 BEST2Q8NFU1 509 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 CGRRF1Q99675 332 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 TLR9Q9NR96 1032 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 SCN1AP35498 2009 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 40.1
ATG13-210ENST00000528145 TSC2P49815 1807 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 FSCN2O14926 492 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 B3GAT3O94766 335 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 IGFBP4P22692 258 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 IRS1P35568 1242 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 STX17P56962 302 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 ADAM9Q13443 819 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 SURF1Q15526 300 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 PTPROQ16827 1216 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 WDR49Q8IV35 697 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 MLKLQ8NB16 471 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 ZBP1Q9H171 429 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 INTS13Q9NVM9 706 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 DPP3Q9NY33 737 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG13-210ENST00000528145 ANO9A1A5B4 782 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 BICDL2A1A5D9 508 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 CETN3O15182 167 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 MAPK13O15264 365 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 TADA2AO75478 443 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 SOD2P04179 222 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 ERVFC1P60507 584 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 VPS52Q8N1B4 723 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 CXorf38Q8TB03 319 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 MED15Q96RN5 788 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 FNBP1Q96RU3 617 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 TCF25Q9BQ70 676 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.45□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 I3L4J1 428 aa14.44□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
ATG13-210ENST00000528145 ITGB3P05106 788 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.3 ms