RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526865.5

RRM1-204, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 4

Gene RRM1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-204	ENST00000526865	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865		J3QW42	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865		M0QZ92	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	CHMP2A	O43633	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	MMP20	O60882	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	CYP3A4	P08684	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	GHR	P10912	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	TGM1	P22735	817 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	STAT5B	P51692	787 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	USP11	P51784	963 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	ERVFC1	P60507	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	ACTR2	P61160	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	INF2	Q27J81	1249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	NELL2	Q99435	816 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	MSH4	O15457	936 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	GAS7	O60861	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	MAP3K6	O95382	1288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	TDP2	O95551	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	CCNE2	O96020	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	PSAP	P07602	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	RARA	P10276	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	INSRR	P14616	1297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	CNR2	P34972	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	KRT2	P35908	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	STARD6	P59095	220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	LPIN1	Q14693	890 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	RABEP1	Q15276	862 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	FAM35A	Q86V20	835 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	CABP7	Q86V35	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	ATCAY	Q86WG3	371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-204	ENST00000526865	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms