RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

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Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTPRK-218ENST00000525459 MARCH5Q9NX47 278 aa20.19■□□□□ 0.82
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PTPRK-218ENST00000525459 PIRO00625 290 aa20.19■□□□□ 0.82
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PTPRK-218ENST00000525459 KRT39Q6A163 491 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-218ENST00000525459 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-218ENST00000525459 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-218ENST00000525459 SLC35C1Q96A29 364 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-218ENST00000525459 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-218ENST00000525459 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-218ENST00000525459 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-218ENST00000525459 BECN2A8MW95 431 aa20.18■□□□□ 0.82
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