RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 MGST3O14880 152 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 PRSS23O95084 383 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CKBP12277 381 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 VAV2P52735 878 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CACNA2D1P54289 1103 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 MYOCQ99972 504 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 VTA1Q9NP79 307 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 TBX22Q9Y458 520 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 KAT6AQ92794 2004 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 PCSK1P29120 753 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 TMPRSS15P98073 1019 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 NHLH1Q02575 133 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 FITM2Q8N6M3 262 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 PNKPQ96T60 521 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.68□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 SLC6A9P48067 706 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 STAT4Q14765 748 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 SEPT2Q15019 361 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 LNX2Q8N448 690 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 ZNF384Q8TF68 577 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 MED15Q96RN5 788 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 MATN4O95460 622 aa6.66□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CPEP16870 476 aa6.66□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 MTM1Q13496 603 aa6.66□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.66□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.65□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CDHR4A6H8M9 788 aa6.65□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 OSMP13725 252 aa6.65□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 GPR3P46089 330 aa6.65□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 MTNR1BP49286 362 aa6.65□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 ATP2B3Q16720 1220 aa6.65□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 GEN1Q17RS7 908 aa6.65□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 SSH3Q8TE77 659 aa6.65□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.65□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 DNM3Q9UQ16 869 aa6.65□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 PEX1O43933 1283 aa6.64□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 C1QL1O75973 258 aa6.64□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 DDCP20711 480 aa6.64□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 NOMO3P69849 1222 aa6.64□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 CREMQ03060 361 aa6.64□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.64□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.64□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 KLK15Q9H2R5 256 aa6.64□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.64□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.63□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 PROP1O75360 226 aa6.63□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 ZFPL1O95159 310 aa6.63□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 AMY1AP04745 511 aa6.63□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 DACT2Q5SW24 774 aa6.63□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.62□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 ORC4O43929 436 aa6.62□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 PRKD3O94806 890 aa6.62□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 SLFN5Q08AF3 891 aa6.62□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.62□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.62□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 WDR26Q9H7D7 661 aa6.62□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.62□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 HAUS5O94927 633 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 EYA4O95677 639 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 FCER1AP12319 257 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 HSD3B2P26439 372 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 FOLR3P41439 243 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 MASP1P48740 699 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP10-11P60412 298 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 ATP8B2P98198 1209 aa6.61□□□□□ -1.35
SGCE-211ENST00000522045 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
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