RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519335.5

BIN3-204, Transcript of bridging integrator 3, humanhuman

TSL 3

Gene BIN3, Length 893 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3-204ENST00000519335 APOL5Q9BWW9 433 aa14.6□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.6□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.6□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 UBE4BO95155 1302 aa14.6□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 FSD2A1L4K1 749 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 CLIC2O15247 247 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 TRAPPC3O43617 180 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 KINO60870 393 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 GPR37L1O60883 481 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 TBX10O75333 385 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 NFICP08651 508 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 BRCC3P46736 316 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 DPYDQ12882 1025 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 STK4Q13043 487 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 PSMD2Q13200 908 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 UPP1Q16831 310 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 CD302Q8IX05 232 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 BEST2Q8NFU1 509 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 TTPALQ9BTX7 342 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 REV3LO60673 3130 aa14.59□□□□□ -0.07
BIN3-204ENST00000519335 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 EXTL3O43909 919 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 GLP2RO95838 553 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 HOXD13P35453 343 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 EHHADHQ08426 723 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 RTP2Q5QGT7 225 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 GPD1LQ8N335 351 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 RDH13Q8NBN7 331 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 CD207Q9UJ71 328 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.58□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 TEX28O15482 410 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 KIF20AO95235 890 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 IL18RAPO95256 599 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 SMC2O95347 1197 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 ADH1AP07327 375 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 EPCAMP16422 314 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 LTBRP36941 435 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 DSG1Q02413 1049 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 PSMD5Q16401 504 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 PALB2Q86YC2 1186 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 CASP10Q92851 521 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 ASB7Q9H672 318 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 PIEZO1Q92508 2521 aa14.57□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 ZNF233A6NK53 670 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 CLSTN1O94985 981 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 SPATA31D3P0C874 917 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 CREMQ03060 361 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 SMARCE1Q969G3 411 aa14.56□□□□□ -0.08
BIN3-204ENST00000519335 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms