RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 GRM6O15303 877 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SBK3P0C264 359 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 CD53P19397 219 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 CASRP41180 1078 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 BLMHQ13867 455 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR16Q569H4 304 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 AFMIDQ63HM1 303 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 PAF1Q8N7H5 531 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF527Q8NB42 609 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 LZTS1Q9Y250 596 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP83Q9Y592 693 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.3□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 NRP1O14786 923 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAM23O75077 832 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 RAP2AP10114 183 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 FGFR2P21802 821 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 CSF2RBP32927 897 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNJ5P48544 419 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 CCT5P48643 541 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ACAP1Q15027 740 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP2B3Q16720 1220 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ALFQ53S48 1182 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC93Q567U6 631 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT40Q6A162 431 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP95Q96GE4 821 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA25Q9BR10 227 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SRRDQ9UH36 339 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ZMYM3Q14202 1370 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 BTN3A1O00481 513 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 FFAR2O15552 330 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 THP07101 528 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 PHKA1P46020 1223 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ADCY7P51828 1080 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 CREMQ03060 361 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF566Q969W8 418 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 MYOCQ99972 504 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNH6Q9H252 994 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G6O60733 806 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ABHD16AO95870 558 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 GNAI3P08754 354 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ALDH9A1P49189 494 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 GNAI1P63096 354 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAM8P78325 824 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 DLG4P78352 724 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC13A2Q13183 592 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 GAGE13Q4V321 117 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 GGT6Q6P531 493 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5M3Q8NGP4 307 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 IQCDQ96DY2 449 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 SERHLQ9NQF3 203 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 TBC1D4O60343 1298 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 NOMO3P69849 1222 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 APBA1Q02410 837 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 TBR1Q16650 682 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ARTNQ5T4W7 220 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 USP30Q70CQ3 517 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 MICU3Q86XE3 530 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 SNX22Q96L94 193 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms