RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEZ6Q53EL9 994 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LIN9Q5TKA1 542 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SV2BQ7L1I2 683 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXL6Q8N531 539 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2orf16Q68DN1 1984 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DENND4AQ7Z401 1863 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VWA8A3KMH1 1905 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAM12O43184 909 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM189A1O60320 539 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POU2F2P09086 479 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TKTP29401 623 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NMT1P30419 496 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF720Q7Z2F6 126 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD302Q8IX05 232 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX12PQ92771 950 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEL1LQ9UBV2 794 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUB1Q9Y5A7 615 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASGR2P07307 311 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C8AP07357 584 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXCL8P10145 99 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRPAP1P30533 357 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPM1LQ5SGD2 360 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLFN12LQ6IEE8 588 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DYMQ7RTS9 669 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF461Q8TAF7 563 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NXPE3Q969Y0 559 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HVCN1Q96D96 273 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUSD3Q96L08 255 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNK12Q9HB15 430 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STYXL1Q9Y6J8 313 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF318Q5VUA4 2279 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYMKA6NI61 221 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LACTBL1A8MY62 500 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H7C4K7 107 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 I3L4J1 428 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XPOTO43592 962 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D4O60343 1298 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP6R2O75170 966 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XYLBO75191 536 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAP43P17677 238 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNFSF9P41273 254 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP2R3AQ06190 1150 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TDGQ13569 410 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC39A4Q6P5W5 647 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSCBQ8IWL3 235 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APPL2Q8NEU8 664 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJC19Q96DA6 116 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF12Q96FN5 646 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRRX2Q99811 253 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MSTO1Q9BUK6 570 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STRA6Q9BX79 667 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPTLC2O15270 562 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABLIM3O94929 683 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STK38Q15208 465 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYADMQ96S97 322 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUC6Q6W4X9 2439 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R37O75864 691 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAMP2P13473 410 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAX3P23760 479 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCM4P33991 863 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STAT6P42226 847 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POSTNQ15063 836 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SFR1Q86XK3 245 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC7A14Q8TBB6 771 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PANK2Q9BZ23 570 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASB7Q9H672 318 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OLFML3Q9NRN5 406 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAFFQ9ULX9 164 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms