RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	KANK3	Q6NY19	840 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	TIGD1	Q96MW7	591 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	TCF25	Q9BQ70	676 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZBP1	Q9H171	429 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	S1PR5	Q9H228	398 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	STK39	Q9UEW8	545 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	IRAK3	Q9Y616	596 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	DMD	P11532	3685 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBE4B	O95155	1302 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131		F8W810	466 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRR29	P0C7W0	189 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CXCL8	P10145	99 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	GART	P22102	1010 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	STK4	Q13043	487 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSMD2	Q13200	908 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTPN21	Q16825	1174 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	VPS52	Q8N1B4	723 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		18.81	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	TGFB1I1	O43294	461 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	RHOBTB3	O94955	611 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CTSA	P10619	480 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD302	Q8IX05	232 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	UROC1	Q96N76	676 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	EXOC1	Q9NV70	894 aa		18.8	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIDE1	A8MVS5	230 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	LACTBL1	A8MY62	500 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	LILRB3	O75022	631 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SOD2	P04179	222 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	AVPR2	P30518	371 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ACOT2	P49753	483 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCNB1	Q14721	858 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	UPP1	Q16831	310 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMC7	Q7Z402	723 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	RABGGTA	Q92696	567 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ASB7	Q9H672	318 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHST7	Q9NS84	486 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIF4A	O95239	1232 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLCNKB	P51801	687 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	FUT10	Q6P4F1	479 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPR65	Q8IYL9	337 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	APOL5	Q9BWW9	433 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		18.78	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	EXTL3	O43909	919 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CXCL14	O95715	111 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CYP3A5	P20815	502 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTPN14	Q15678	1187 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		18.77	■□□□□ 0.6

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