RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 CNDP1Q96KN2 507 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 OLFM1Q99784 485 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 WACQ9BTA9 647 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 USP29Q9HBJ7 922 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 POLD4Q9HCU8 107 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 CNTN3Q9P232 1028 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 VPS51Q9UID3 782 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 MBD5Q9P267 1494 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 FANCAO15360 1455 aa6.52□□□□□ -1.36
PDE4D-216ENST00000507116 ENC1O14682 589 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FYB1O15117 783 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DNAJB5O75953 348 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 BAG2O95816 211 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PKLRP30613 574 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SOX11P35716 441 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NUDT1P36639 197 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ADCY7P51828 1080 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PRAMEP78395 509 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RHAGQ02094 409 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TAP1Q03518 808 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 C2orf54Q08AI8 447 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ACAP2Q15057 778 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CLUL1Q15846 466 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CDH26Q8IXH8 852 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ANKS1AQ92625 1134 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SGF29Q96ES7 293 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PBKQ96KB5 322 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CDRT15Q96T59 188 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DESI2Q9BSY9 194 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PIF1Q9H611 641 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ACAD9Q9H845 621 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FANCLQ9NW38 375 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DMTF1Q9Y222 760 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CD109Q6YHK3 1445 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 A0A087WZG4 1122 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OPHN1O60890 802 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RGS20O76081 388 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PRKCAP17252 672 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LIMK1P53667 647 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RGS21Q2M5E4 152 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FUT11Q495W5 492 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RANBP10Q6VN20 620 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MREGQ8N565 214 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM77I1YAP6 450 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ADCY6O43306 1168 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GREM1O60565 184 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 A1BGP04217 495 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CCNB1P14635 433 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 VAMP1P23763 118 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PTPN21Q16825 1174 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 KRT24Q2M2I5 525 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FAM209BQ5JX69 171 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 BEND4Q6ZU67 534 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TTC9Q92623 222 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SDF4Q9BRK5 362 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.52□□□□□ -1.37
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