RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 POMCP01189 267 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 AOC1P19801 751 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 CA8P35219 290 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 MLH1P40692 756 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 MTHFRP42898 656 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 ITIH3Q06033 890 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 MCL1Q07820 350 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 KCNA1Q09470 495 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 STK4Q13043 487 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 CAMK4Q16566 473 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMC7Q7Z402 723 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRRC43Q8N309 656 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 DTWD2Q8NBA8 298 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 ACAP3Q96P50 834 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 GAD1Q99259 594 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 HINFPQ9BQA5 517 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 STRA6Q9BX79 667 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 CWH43Q9H720 699 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 KANSL3Q9P2N6 904 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa11.96□□□□□ -0.49
CD27-AS1-204ENST00000504270 ARL5CA6NH57 179 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 PPP1R37O75864 691 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 RECQL4O94761 1208 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 PIGRP01833 764 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 PROZP22891 400 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 PBX3P40426 434 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 GRM5P41594 1212 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 SCNN1GP51170 649 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLCB3Q01970 1234 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 KCNB1Q14721 858 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 KYAT1Q16773 422 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 SEZ6Q53EL9 994 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 CEP120Q8N960 986 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 KCNN1Q92952 543 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZFP42Q96MM3 310 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 GSDMAQ96QA5 445 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 RNF19AQ9NV58 838 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 R4GN57 208 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 CEP250Q9BV73 2442 aa11.95□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 A0A0B4J269 797 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 TISP43B9A030 160 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 OGTO15294 1046 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 RHOBTB3O94955 611 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLTAP09496 248 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 NPR3P17342 541 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 EHHADHQ08426 723 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 ISM2Q6H9L7 571 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAM212AQ96EL1 285 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 TBC1D13Q9NVG8 400 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 UBE4BO95155 1302 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 BIN1O00499 593 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 ABLIM1O14639 778 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 THP07101 528 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 KRT17Q04695 432 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIAA1841Q6NSI8 718 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRRC55Q6ZSA7 311 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 SIX5Q8N196 739 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 SAAL1Q96ER3 474 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF558Q96NG5 402 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms