RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 ACY1Q03154 408 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 AP1B1Q10567 949 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SSPNQ14714 243 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SHHQ15465 462 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SBK1Q52WX2 424 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LCORLQ8N3X6 602 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 IRGQQ8WZA9 623 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBED2Q9BTP6 218 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 STX8Q9UNK0 236 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PQY0 241 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 A6NHS1 94 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 F5H6K3 240 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SPTLC1O15269 473 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 YKT6O15498 198 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 TACC1O75410 805 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX4O95219 450 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GUCA1CO95843 209 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PGK1P00558 417 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMP1P01033 207 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KLRC3Q07444 240 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NFE2L1Q14494 772 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 FAM26DQ5JW98 314 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TCERG1LQ5VWI1 586 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MFSD5Q6N075 450 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NSMFQ6X4W1 530 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF554Q86TJ5 538 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
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RABGGTB-213ENST00000496055 CEP112Q8N8E3 955 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 OR6C4Q8NGE1 309 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PANK1Q8TE04 598 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
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