RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 ARVCFO00192 962 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 KRT15P19012 456 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 FGFR2P21802 821 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 IL13RA1P78552 427 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 PAK1Q13153 545 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 SEC23AQ15436 765 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 TM4SF20Q53R12 229 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 MIIPQ5JXC2 388 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 TTC39AQ5SRH9 613 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 CEP85Q6P2H3 762 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 OSTM1Q86WC4 334 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 C2orf69Q8N8R5 385 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 CFHR4Q92496 578 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 SCLYQ96I15 445 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 GPATCH3Q96I76 525 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 MXD3Q9BW11 206 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 GPR108Q9NPR9 543 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 TMOD2Q9NZR1 351 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 PGAP2Q9UHJ9 254 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 COQ6Q9Y2Z9 468 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 PSME4Q14997 1843 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 ZNF609O15014 1411 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 A0A1B0GUL6 1792 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 SHTN1A0MZ66 631 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 WNT10BO00744 389 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 AQP7O14520 342 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 WNT9AO14904 365 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 RAB11FIP3O75154 756 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 CELF2O95319 508 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 MPIG6BO95866 241 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 PDE6AP16499 860 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 HSD3B2P26439 372 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 DNM2P50570 870 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 JAM2P57087 298 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 GABREP78334 506 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 FOXE3Q13461 319 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 TNFAIP1Q13829 316 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 DEFB115Q30KQ5 88 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 CFAP100Q494V2 611 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 C2orf27AQ580R0 203 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 BTBD8Q5XKL5 378 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 JMYQ8N9B5 988 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 EDAQ92838 391 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 TEKT1Q969V4 418 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 MKL1Q969V6 931 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 KIF1BPQ96EK5 621 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 VEZTQ9HBM0 779 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 GGA3Q9NZ52 723 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 BTBD7Q9P203 1132 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 ABCF2Q9UG63 623 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-240ENST00000495293 PASKQ96RG2 1323 aa5.4□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 SCN9AQ15858 1988 aa5.4□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 CCDC66A2RUB6 948 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 CLSTN1O94985 981 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 LDHCP07864 332 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 COMTP21964 271 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 ADCY8P40145 1251 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 ECE1P42892 770 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 PHKA1P46020 1223 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 GSTO1P78417 241 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 SQSTM1Q13501 440 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 PTPROQ16827 1216 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 C20orf194Q5TEA3 1177 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 BRAPQ7Z569 592 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 AACSQ86V21 672 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 CERS5Q8N5B7 392 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 SPATA5Q8NB90 893 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 GSTCDQ8NEC7 633 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 FBXW5Q969U6 566 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-240ENST00000495293 AMNQ9BXJ7 453 aa5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms