RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 GNAT1P11488 350 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT5P13647 590 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PDE6CP51160 858 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 GJA9P57773 515 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 OSTNP61366 133 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAM17P78536 824 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CUL2Q13617 745 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 KIZQ2M2Z5 673 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 RUFY4Q6ZNE9 571 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKLE1Q8NAG6 615 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 TSC1Q92574 1164 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 CPB2Q96IY4 423 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 ADPGKQ9BRR6 497 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 MTMR12Q9C0I1 747 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SPC25Q9HBM1 224 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 OGDHLQ9ULD0 1010 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 SAR1BQ9Y6B6 198 aa11.15□□□□□ -0.62
GTPBP1-211ENST00000487538 EVPLQ92817 2033 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 H0YGN5 161 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ENC1O14682 589 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SEPT4O43236 478 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR32O75388 356 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CLSTN1O94985 981 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 STAG3L1P0CL83 205 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CXCL8P10145 99 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RARBP10826 455 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP11B1P15538 503 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CAPN2P17655 700 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CHRNB2P17787 502 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GALCP54803 685 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 BPIFB4P59827 614 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NKX3-2P78367 333 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CDR2Q01850 454 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TRPC3Q13507 836 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 LHX8Q68G74 356 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 C7orf31Q8N865 590 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP120Q8N960 986 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ARID3AQ99856 593 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.14□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GUA9 196 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD62A6NC57 917 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 MYADML2A6NDP7 307 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PALMO75781 387 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GZMAP12544 262 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 DARSP14868 501 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PRLRP16471 622 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXC8P31273 242 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NOP2P46087 812 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 MYL6P60660 151 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM62Q0P6H9 643 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 HIC1Q14526 733 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GNASQ5JWF2 1037 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TAF3Q5VWG9 929 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF677Q86XU0 584 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RFFLQ8WZ73 363 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 UBXN4Q92575 508 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TAF4BQ92750 862 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA1Q92805 767 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PRO3102Q9H379 93 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ASB7Q9H672 318 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
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