RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 INTS13Q9NVM9 706 aa10.52□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa10.52□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 FAN1Q9Y2M0 1017 aa10.52□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa10.52□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 LTBP2Q14767 1821 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 BRCA2P51587 3418 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 PMM2O15305 246 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 FAM189A1O60320 539 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 LPXNO60711 386 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TADA2AO75478 443 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 RFX1P22670 979 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 OR1G1P47890 313 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TAF6P49848 677 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TNNC1P63316 161 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 CLDN10P78369 228 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB103AP81534 67 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 UBXN1Q04323 297 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 IQCB1Q15051 598 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 SHHQ15465 462 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 PDXDC1Q6P996 788 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 METTL23Q86XA0 190 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM59Q8IWR1 403 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 FBXL13Q8NEE6 735 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01599Q8WXQ3 324 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM169Q96HH4 297 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 HAPLN2Q9GZV7 340 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 IKZF4Q9H2S9 585 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 SLC28A3Q9HAS3 691 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 DSEQ9UL01 958 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 SCN5AQ14524 2016 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 MICAL3Q7RTP6 2002 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC10BA6NIK2 292 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 HUS1O60921 280 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 B3GAT3O94766 335 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 LRPAP1P30533 357 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 GCLMP48507 274 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 FMO5P49326 533 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 NCOA4Q13772 614 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 KRT31Q15323 416 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 EXOC3L4Q17RC7 722 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 GLRA4Q5JXX5 417 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 CLLU1OSQ5K130 101 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.5□□□□□ -0.73
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CTPS1-210ENST00000486889 SV2AQ7L0J3 742 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM192Q8IY95 271 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 DEFB123Q8N688 67 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 SLC35C1Q96A29 364 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 ZFP42Q96MM3 310 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 CASD1Q96PB1 797 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 NUP58Q9BVL2 599 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 PLVAPQ9BX97 442 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM5Q9C035 493 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 VPS16Q9H269 839 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TBC1D13Q9NVG8 400 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 RAB20Q9NX57 234 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 AGAP1Q9UPQ3 857 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.739e-6■■■■■ 68.9
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CTPS1-210ENST00000486889 PODXLO00592 558 aa10.49□□□□□ -0.73
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CTPS1-210ENST00000486889 RB1P06400 928 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 NFICP08651 508 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC172P0C7W6 258 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM49P0CI25 452 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM49CP0CI26 452 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF18P17022 549 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 COPB1P53618 953 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 EPHB4P54760 987 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 MFAP3P55082 362 aa10.49□□□□□ -0.73
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CTPS1-210ENST00000486889 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
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CTPS1-210ENST00000486889 NCAPHQ15003 741 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF699Q32M78 642 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 ZACNQ401N2 412 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF667Q5HYK9 610 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-210ENST00000486889 RASIP1Q5U651 963 aa10.49□□□□□ -0.73
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