RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CCT4P50991 539 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ANTXR2P58335 489 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ADCY2Q08462 1091 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 FOXE3Q13461 319 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ACAP1Q15027 740 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D9BQ66K14 1250 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CREB3L3Q68CJ9 461 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 KRT40Q6A162 431 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 C16orf86Q6ZW13 317 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 USP44Q9H0E7 712 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 NUP188Q5SRE5 1749 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RREB1Q92766 1687 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 UBN2Q6ZU65 1347 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ERVV-1B6SEH8 477 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 MAFGO15525 162 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CDC45O75419 566 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GYS1P13807 737 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PTH1RQ03431 593 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CRHR2Q13324 411 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GCKRQ14397 625 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 TKFCQ3LXA3 575 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CRB2Q5IJ48 1285 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SUSD4Q5VX71 490 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PASD1Q8IV76 773 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NXPE1Q8N323 547 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 LINS1Q8NG48 757 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 WDR92Q96MX6 357 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ISCA1Q9BUE6 129 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 POFUT1Q9H488 388 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 C4AP0C0L4 1744 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf78A6NCI8 922 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GRM8O00222 908 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 DAPK3O43293 454 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ALDH1L1O75891 902 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SLPIP03973 132 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CD40P25942 277 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ADCY7P51828 1080 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SART3Q15020 963 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 MIIPQ5JXC2 388 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NIM1KQ8IY84 436 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NINJ1Q92982 152 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 SUCLG2Q96I99 432 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 MYL10Q9BUA6 226 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 MTG2Q9H4K7 406 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 DDX19BQ9UMR2 479 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NPHP1O15259 732 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 TOX4O94842 621 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 F2P00734 622 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 ACVRL1P37023 503 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 DSG1Q02413 1049 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 DDR1Q08345 913 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 GAREM2Q75VX8 874 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 KIF18BQ86Y91 864 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 EFHBQ8N7U6 833 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms