RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 TTC26A0AVF1 554 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 CCL16O15467 120 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 PIGRP01833 764 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 GTF2BQ00403 316 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 SNX21Q969T3 373 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 PANK2Q9BZ23 570 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 STK17AQ9UEE5 414 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 TRIP11Q15643 1979 aa20.48■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 VWA8A3KMH1 1905 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 MYH11P35749 1972 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 LACTBL1A8MY62 500 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 FAM189A1O60320 539 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 SCP2P22307 547 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 TXLNAP40222 546 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 NTHL1P78549 312 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 TDGQ13569 410 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 SFR1Q86XK3 245 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 DDX12PQ92771 950 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 KIF12Q96FN5 646 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 POLIQ9UNA4 740 aa20.47■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 A0A0B4J269 797 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 MYMKA6NI61 221 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 TISP43B9A030 160 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 SYN3O14994 580 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 OGTO15294 1046 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 MCM4P33991 863 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 SV2BQ7L1I2 683 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 KCNH6Q9H252 994 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.46■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 A0A087X0B3 334 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 AVPR2P30518 371 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 GUCY2FP51841 1108 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 ARPP19P56211 112 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 ROR1Q01973 937 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB6Q15916 424 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 UVSSAQ2YD98 709 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 FAM212AQ96EL1 285 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 SUSD3Q96L08 255 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 MYO10Q9HD67 2058 aa20.45■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D4O60343 1298 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 LAMP2P13473 410 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 FSHRP23945 695 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 HOXA9P31269 272 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 STK38Q15208 465 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 KYAT1Q16773 422 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 PRSS33Q8NF86 280 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 WDR27A2RRH5 827 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 H7C4K7 107 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 XYLBO75191 536 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 ADRB2P07550 413 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 CYP3A5P20815 502 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 LRPAP1P30533 357 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 ABCD1P33897 745 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 STAT6P42226 847 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 ACOT2P49753 483 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 HSCBQ8IWL3 235 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 PDILTQ8N807 584 aa20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UPP1-211ENST00000482015 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms