RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 NELL1Q92832 810 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CLDN23Q96B33 292 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 GDAQ9Y2T3 454 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 STK36Q9NRP7 1315 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 LILRB5O75023 590 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 LIG1P18858 919 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ATP2B1P20020 1258 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 TKTP29401 623 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 HOXA9P31269 272 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 KRT2P35908 639 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 BRCC3P46736 316 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CLCNKBP51801 687 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 USP46P62068 366 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 GUCA2AQ02747 115 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 UVSSAQ2YD98 709 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 MTSS1LQ765P7 747 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 HEBP1Q9NRV9 189 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 MTRRQ9UBK8 725 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ACKR2O00590 384 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 N4BP3O15049 544 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 XYLBO75191 536 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ECI2O75521 394 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CDKL5O76039 1030 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 B3GAT3O94766 335 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 LARGE1O95461 756 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 SEC24AO95486 1093 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PRKCBP05771 671 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 RHOP08100 348 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CEBPBP17676 345 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 XBP1P17861 261 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 MTAPQ13126 283 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 MCM6Q14566 821 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ECM1Q16610 540 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ME3Q16798 604 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PARD6AQ9NPB6 346 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 NCDNQ9UBB6 729 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 FRYLO94915 3013 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D4O60343 1298 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 NEMFO60524 1076 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 JAK2O60674 1132 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 MOSPD3O75425 235 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ABLIM3O94929 683 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 POU2F2P09086 479 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 TDGF1P13385 188 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PTPN2P17706 415 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CYP11B2P19099 503 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 FCARP24071 287 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CCR2P41597 374 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ARPP19P56211 112 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PFKPQ01813 784 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 GRM2Q14416 872 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 MAPK6Q16659 721 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 UPP1Q16831 310 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CEP120Q8N960 986 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-208ENST00000479480 NACC1Q96RE7 527 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms