RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 VIMP08670 466 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 CALRP27797 417 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 GBP1P32455 592 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TAS2R40P59535 323 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TMC2Q8TDI7 906 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 SGSM3Q96HU1 749 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 DCLK3Q9C098 648 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 WHRNQ9P202 907 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 RALAP11233 206 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TCF4P15884 667 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 SP4Q02446 784 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ADCY1Q08828 1119 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 CALCOCO2Q13137 446 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 PASD1Q8IV76 773 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 CEP170P1Q96L14 293 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 PDLIM7Q9NR12 457 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 SNX3O60493 162 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TTC4O95801 387 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 FDX1P10109 184 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 GHRP10912 638 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 GCNT1Q02742 428 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 PTK6Q13882 451 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 MON1BQ7L1V2 547 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 FAM83AQ86UY5 434 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 GPD1LQ8N335 351 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 RNF217Q8TC41 542 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TEPSINQ96N21 525 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 IWS1Q96ST2 819 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TIPINQ9BVW5 301 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 RLFQ13129 1914 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 VNN1O95497 513 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 JAK3P52333 1124 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 MTMR2Q13614 643 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ITIH4Q14624 930 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 SNF8Q96H20 258 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TBK1Q9UHD2 729 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 CHUKO15111 745 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 MGRN1O60291 552 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 EDN1P05305 212 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ACOT2P49753 483 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 CDR1P51861 262 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 CENPCQ03188 943 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 CGB2Q6NT52 195 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 KIFAP3Q92845 792 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 RUNDC3BQ96NL0 473 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF541Q9H0D2 1346 aa11.65□□□□□ -0.54
C9orf3-214ENST00000473778 KIF3CO14782 793 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf3-214ENST00000473778 UBOX5O94941 541 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf3-214ENST00000473778 KCNA2P16389 499 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf3-214ENST00000473778 CD58P19256 250 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms