RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 DTX3Q8N9I9 347 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 GDF15Q99988 308 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 DLL4Q9NR61 685 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDT19A8MXV4 375 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 B4E171 279 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 AREL1O15033 823 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFRSF6BO95407 300 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 NDST3O95803 873 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 HPXP02790 462 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CD1AP06126 327 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGA5P08648 1049 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 GAAP10253 952 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPAN7P41732 249 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 LIFRP42702 1097 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 GATA4P43694 442 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 NUCB1Q02818 461 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ICE2Q659A1 982 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 UNC13DQ70J99 1090 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 MICU3Q86XE3 530 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 LILRA2Q8N149 483 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 RUBCNQ92622 972 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SHISA4Q96DD7 197 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC46Q96FV0 321 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR92Q96MX6 357 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM140Q9NV12 185 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR19A6NJB7 356 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 H0Y858 1186 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PIP5K1BO14986 540 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SOAT2O75908 522 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD16AO95870 558 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 IL18BPO95998 194 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CD8BP10966 210 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 GLRBP48167 497 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ERVFC1P60507 584 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ERVFRD-1P60508 538 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 CTXN1P60606 82 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 MTM1Q13496 603 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB32Q13637 225 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM110CQ1W6H9 321 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ADCK5Q3MIX3 580 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 BORAQ6PGQ7 559 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 RPTNQ6XPR3 784 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 GLIS1Q8NBF1 620 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SPPL3Q8TCT6 385 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 SERINC2Q96SA4 455 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 STK31Q9BXU1 1019 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TLR9Q9NR96 1032 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF17Q9P2E2 1029 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF212Q9UDV6 495 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 MATN4O95460 622 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TBX18O95935 607 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 IL1R1P14778 569 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 RRM1P23921 792 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 PCSK1P29120 753 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 GUCY1A2P33402 732 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAM9Q13443 819 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms