RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469147.5

TRAPPC12-215, Transcript of trafficking protein particle complex 12, human

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 1,002 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC12-215	ENST00000469147	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	LTBR	P36941	435 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PRCP	P42785	496 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SLC11A1	P49279	550 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ACOT2	P49753	483 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	KRT17	Q04695	432 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	MORC3	Q14149	939 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	NAB2	Q15742	525 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CAMK4	Q16566	473 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TMEM169	Q96HH4	297 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TLE6	Q9H808	572 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	LACTBL1	A8MY62	500 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	NRP1	O14786	923 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	MAPK13	O15264	365 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	FGF18	O76093	207 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	NR3C1	P04150	777 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	OR1G1	P47890	313 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	NRIP1	P48552	1158 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ERVFC1	P60507	584 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	LRRC63	Q05C16	580 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	HYAL1	Q12794	435 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZBTB6	Q15916	424 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CENPP	Q6IPU0	288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ADSSL1	Q8N142	457 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	BEST2	Q8NFU1	509 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	POF1B	Q8WVV4	589 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SAAL1	Q96ER3	474 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	KIF12	Q96FN5	646 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	IGSF21	Q96ID5	467 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TSG101	Q99816	390 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	BICDL2	A1A5D9	508 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CLIC2	O15247	247 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	MBTPS2	O43462	519 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	EXOC3	O60645	756 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	PAX3	P23760	479 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	NR2F2	P24468	414 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CCNE1	P24864	410 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	LRPAP1	P30533	357 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CYP2J2	P51589	502 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ZP2	Q05996	745 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ENPEP	Q07075	957 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SPATA1	Q5VX52	437 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	JADE1	Q6IE81	842 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	USP37	Q86T82	979 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	ANK1	P16157	1881 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAPPC12-215	ENST00000469147	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74	6e-6	■■■■■ 74.9
TRAPPC12-215	ENST00000469147	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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