RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.59■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 NCANO14594 1321 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 ACKR2O00590 384 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 MOSPD3O75425 235 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 LRG1P02750 347 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 GDI1P31150 447 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 HOXC13P31276 330 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 VIPR2P41587 438 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 CXCL12P48061 93 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 CCR3P51677 355 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 SCRN1Q12765 414 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 IRF7Q92985 503 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 TNFRSF25Q93038 417 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.58■□□□□ 0.89
LINC00888-201ENST00000468380 COL4A2P08572 1712 aa20.58■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 TRIP11Q15643 1979 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 MICAL2O94851 1124 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 PRKCBP05771 671 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 ATF2P15336 505 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 PSMC3P17980 439 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 LIG1P18858 919 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 ATP2B1P20020 1258 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 TXKP42681 527 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 FNTBP49356 437 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CSRP2Q16527 193 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 IER2Q9BTL4 223 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.57■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 PRRG1O14668 218 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CCNE1P24864 410 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 ELF1P32519 619 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 PPP2R5DQ14738 602 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CALCRLQ16602 461 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 MAPK6Q16659 721 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 WDR44Q5JSH3 913 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 SMARCD2Q92925 531 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 MTMR9Q96QG7 549 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 POLD4Q9HCU8 107 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.56■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 K7ESF4 209 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 ARNTLO00327 626 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF197O14709 1029 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 TRAPPC3O43617 180 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CTDNEP1O95476 244 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 GJA1P17302 382 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 ARPP19P56211 112 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CEP72Q9P209 647 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.55■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 MED24O75448 989 aa20.54■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 XBP1P17861 261 aa20.54■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.54■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.54■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 UROC1Q96N76 676 aa20.54■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.54■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 STK36Q9NRP7 1315 aa20.53■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 PTGDRQ13258 359 aa20.53■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.53■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.53■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.53■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CEP120Q8N960 986 aa20.53■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.53■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.53■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 TM4SF5O14894 197 aa20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF263O14978 683 aa20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CDKL5O76039 1030 aa20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 CYP11B2P19099 503 aa20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 KRT2P35908 639 aa20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 XKR4Q5GH76 650 aa20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 PADI6Q6TGC4 694 aa20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 Q6ZS52 159 aa20.52■□□□□ 0.88
LINC00888-201ENST00000468380 LONP2Q86WA8 852 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms