RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa2.09□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.09□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 GPRASP2Q96D09 838 aa2.09□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 ANAPC16Q96DE5 110 aa2.09□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 SGSM3Q96HU1 749 aa2.09□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 C5orf34Q96MH7 638 aa2.09□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 POT1Q9NUX5 634 aa2.09□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 SELENONQ9NZV5 590 aa2.09□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 URI1O94763 535 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 TTLL1O95922 423 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PSG1P11464 419 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 ADCY2Q08462 1091 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 KCNA1Q09470 495 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 MFSD14BQ5SR56 506 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 CEP85Q6P2H3 762 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 C8orf58Q8NAV2 365 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM87AQ8NBN3 555 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 MDM1Q8TC05 714 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 LPIN2Q92539 896 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 ACTR10Q9NZ32 417 aa2.08□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 SCN5AQ14524 2016 aa2.07□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 WDR27A2RRH5 827 aa2.07□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP12-2P59991 146 aa2.07□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa2.07□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PTPRN2Q92932 1015 aa2.07□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 ANO3Q9BYT9 981 aa2.07□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP2.07□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa2.07□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 B4DGG1 531 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF432O94892 652 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 BAG4O95429 457 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 C10orf25Q5T742 122 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 OVCH1Q7RTY7 1134 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 SLC30A5Q8TAD4 765 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF479Q96JC4 524 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 FAM234AQ9H0X4 552 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PODXL2Q9NZ53 605 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 WDR17Q8IZU2 1322 aa2.06□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PR48 441 aa2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 ITGA10O75578 1167 aa2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 NGFRP08138 427 aa2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 TNFRSF8P28908 595 aa2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 FLT3LGP49771 235 aa2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 MLXIPQ9HAP2 919 aa2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 INTS13Q9NVM9 706 aa2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 STRIP2Q9ULQ0 834 aa2.05□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 TRAV20A0A0B4J274 112 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 VWC2LB2RUY7 222 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 ACOT8O14734 319 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PRSS23O95084 383 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 GJB6O95452 261 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 FANCCQ00597 558 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 E2F1Q01094 437 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 FXNQ16595 210 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 FOXB2Q5VYV0 432 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 KIAA1841Q6NSI8 718 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PIP4P1Q86T03 277 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PIM3Q86V86 326 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 Q8NA96 180 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 KLHL13Q9P2N7 655 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 ICAM5Q9UMF0 924 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 COQ6Q9Y2Z9 468 aa2.04□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 EVPLQ92817 2033 aa2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 UMODP07911 640 aa2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 KIF11P52732 1056 aa2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 RAP2BP61225 183 aa2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 NME9Q86XW9 330 aa2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 DRC7Q8IY82 874 aa2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 BOCQ9BWV1 1114 aa2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 HSFX1Q9UBD0 423 aa2.03□□□□□ -2.08
SHQ1-204ENST00000468347 FCHO1O14526 889 aa2.02□□□□□ -2.09
SHQ1-204ENST00000468347 APOL3O95236 402 aa2.02□□□□□ -2.09
SHQ1-204ENST00000468347 CRTAMO95727 393 aa2.02□□□□□ -2.09
SHQ1-204ENST00000468347 EBLN1P0CF75 366 aa2.02□□□□□ -2.09
SHQ1-204ENST00000468347 GATA3P23771 443 aa2.02□□□□□ -2.09
SHQ1-204ENST00000468347 FAM47AQ5JRC9 791 aa2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms