RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 WDR49Q8IV35 697 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 HASPINQ8TF76 798 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 CEP63Q96MT8 703 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 FAM161BQ96MY7 647 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 UROC1Q96N76 676 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 SAMD11Q96NU1 681 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 CGRRF1Q99675 332 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 INTS13Q9NVM9 706 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 MARCH5Q9NX47 278 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 DPP3Q9NY33 737 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 SPG21Q9NZD8 308 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TRIP11Q15643 1979 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 ANK1P16157 1881 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 RFXAPO00287 272 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 PPEF2O14830 753 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TADA2AO75478 443 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 FGF18O76093 207 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 B3GAT3O94766 335 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TNNC2P02585 160 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 ITGB3P05106 788 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 ITGB1P05556 798 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 KRT19P08727 400 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 CYP3A5P20815 502 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 RPL9P32969 192 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 GPM6BQ13491 265 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 Q7L0L9 218 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 USP37Q86T82 979 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TMC2Q8TDI7 906 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF516Q92618 1163 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 BORCS6Q96GS4 357 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM169Q96HH4 297 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 IGSF21Q96ID5 467 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 PLVAPQ9BX97 442 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 SZT2Q5T011 3432 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 H3BNC9 293 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 GRM6O15303 877 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 PHACTR2O75167 634 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 CLSTN1O94985 981 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 GNA14O95837 355 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 RB1P06400 928 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 LRPAP1P30533 357 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 PPM1AP35813 382 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 GCLMP48507 274 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 CLDN10P78369 228 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 MYL5Q02045 173 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 KRT17Q04695 432 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 BIRC3Q13489 604 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 GRIN2CQ14957 1233 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 THAP9Q9H5L6 903 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-202ENST00000467691 ITGA11Q9UKX5 1188 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms