RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466596.5

HS3ST3B1-202, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

TSL 2

Gene HS3ST3B1, Length 2,808 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 WDR91A4D1P6 747 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SORBS3O60504 671 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GGPS1O95749 300 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RNF43Q68DV7 783 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANO7Q6IWH7 933 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LONP2Q86WA8 852 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SEMA4DQ92854 862 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 WHRNQ9P202 907 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 USP20Q9Y2K6 914 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 VAMP7P51809 220 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SOX10P56693 466 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PHTF1Q9UMS5 762 aa15.95■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLX4Q8IY92 1834 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 BANF1O75531 89 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ITGB5P18084 799 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ATP5DP30049 168 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRELPP51888 382 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 STRN3Q13033 797 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CPXCR1Q8N123 301 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GLIS1Q8NBF1 620 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PIDD1Q9HB75 910 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 USTQ9Y2C2 406 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NFIBO00712 420 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 AP1G2O75843 785 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 POLR2MP0CAP2 368 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GNAZP19086 355 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ATP4AP20648 1035 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PSMC4P43686 418 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SPP2Q13103 211 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CEP55Q53EZ4 464 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CPA5Q8WXQ8 436 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.94■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TPBGLP0DKB5 382 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 T-ENOLP0DO92 83 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ITIH2P19823 946 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HSPA1LP34931 641 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SARNPP82979 210 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RASA3Q14644 834 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SETDB1Q15047 1291 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LRRC37BQ96QE4 947 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 A6NHS1 94 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FSCN2O14926 492 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KRT5P13647 590 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ETS1P14921 441 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CALB2P22676 271 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 YY1P25490 414 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KAZNQ674X7 775 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CBWD2Q8IUF1 395 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.93■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CDH16O75309 829 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MXI1P50539 228 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IL9RQ01113 521 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PASD1Q8IV76 773 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HAUS1Q96CS2 278 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DCLK3Q9C098 648 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC26A4O43511 780 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ADRB2P07550 413 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RALAP11233 206 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FGFR1P11362 822 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MAPK4P31152 587 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC15A2Q16348 729 aa15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HS3ST3B1-202ENST00000466596 UGCGQ16739 394 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms