RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466579.1

SDCCAG3-208, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, human

TSL 1 (best)

Gene SDCCAG3, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FNIP2	Q9P278	1114 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PODXL	O00592	558 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LINC01565	O15544	149 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TBX10	O75333	385 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TADA2A	O75478	443 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	B3GAT3	O94766	335 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PAPLN	O95428	1278 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	UROD	P06132	367 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FGFR3	P22607	806 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PAX3	P23760	479 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	UBE2H	P62256	183 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	JADE1	Q6IE81	842 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GPD1L	Q8N335	351 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RABGGTA	Q92696	567 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KIF12	Q96FN5	646 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ASB2	Q96Q27	587 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CLEC1B	Q9P126	229 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SCN1A	P35498	2009 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PLXNA3	P51805	1871 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PIR	O00625	290 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PDXK	O00764	312 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PER2	O15055	1255 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TRAPPC3	O43617	180 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NFIC	P08651	508 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BMP1	P13497	986 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	WNT7B	P56706	349 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CREM	Q03060	361 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TFF2	Q03403	129 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PNOC	Q13519	176 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NFIL3	Q16649	462 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PDXDC1	Q6P996	788 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SAAL1	Q96ER3	474 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SUSD3	Q96L08	255 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IGFLR1	Q9H665	355 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CLDND1	Q9NY35	253 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VCAN	P13611	3396 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579		M0QZQ0	153 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SYN3	O14994	580 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TEX28	O15482	410 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TBC1D4	O60343	1298 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CSPG5	O95196	566 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KIF20A	O95235	890 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KCNA5	P22460	613 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CLCN4	P51793	760 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SPAG1	Q07617	926 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		10.27	□□□□□ -0.77

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