RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 H2AFZP0C0S5 128 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 AXLP30530 894 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 KCNA10Q16322 511 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 H2AFVQ71UI9 128 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ACAP3Q96P50 834 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 NFICP08651 508 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 JADE1Q6IE81 842 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CENPFP49454 3210 aa22.93■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ANO9A1A5B4 782 aa22.93■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 FKTNO75072 461 aa22.93■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CYP11B1P15538 503 aa22.93■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 MYL6P60660 151 aa22.93■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 HTRA3P83110 453 aa22.93■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TUBB2AQ13885 445 aa22.93■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ARHGEF6Q15052 776 aa22.93■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.93■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 MYH10P35580 1976 aa22.92■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 RSPH3Q86UC2 560 aa22.92■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SESTD1Q86VW0 696 aa22.92■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.92■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 M0QZ92 97 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 BUB1O43683 1085 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CHRNB2P17787 502 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ZNF699Q32M78 642 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TAF3Q5VWG9 929 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 RNF180Q86T96 592 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CD302Q8IX05 232 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ACP6Q9NPH0 428 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 GALCP54803 685 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 BPIFB4P59827 614 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CDR2Q01850 454 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SERINC5Q86VE9 423 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 PALB2Q86YC2 1186 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TAF4BQ92750 862 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CDC23Q9UJX2 597 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 C2CD2Q9Y426 696 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ENC1O14682 589 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TMEM253P0C7T8 217 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 FMO1Q01740 532 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 MMEP08473 750 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 KRT19P08727 400 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 PRMT2P55345 433 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 AMPD2Q01433 879 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SIX4Q9UIU6 781 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 HTTP42858 3142 aa22.89■■□□□ 1.25
CTU2-202ENST00000453996 NCANO14594 1321 aa22.89■■□□□ 1.25
CTU2-202ENST00000453996 INHAP05111 366 aa22.89■■□□□ 1.25
CTU2-202ENST00000453996 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CTU2-202ENST00000453996 ZNF677Q86XU0 584 aa22.89■■□□□ 1.25
CTU2-202ENST00000453996 MNS1Q8NEH6 495 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms