RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438490.2

RALGAPB-204, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 5

Gene RALGAPB, Length 4,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-204	ENST00000438490	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	FSCN2	O14926	492 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	EXTL3	O43909	919 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	LSP1	P33241	339 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PDE6C	P51160	858 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DNA2	P51530	1060 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	BACE1	P56817	501 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PGM2	Q96G03	612 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	FMO2	Q99518	471 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	MYO1F	O00160	1098 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	CYP11B1	P15538	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	ABCB4	P21439	1286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	RWDD2B	P57060	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	GRM1	Q13255	1194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	ANO5	Q75V66	913 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	ALG3	Q92685	438 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATP9A	O75110	1047 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	LRRN2	O75325	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	COMT	P21964	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	AP3M2	P53677	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	CAV1	Q03135	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRADD	Q15628	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	P3H4	Q92791	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	WHRN	Q9P202	907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF862	O60290	1169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	FAM107A	O95990	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	KRT14	P02533	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RALGAPB-204	ENST00000438490	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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