RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436228.6

SPDYE2B-201, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-201ENST00000436228 EDRF1Q3B7T1 1238 aa18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CEP135Q66GS9 1140 aa18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 FBXL18Q96ME1 805 aa18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 BICDL2A1A5D9 508 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TNFRSF10AO00220 468 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 PODXLO00592 558 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 B3GAT3O94766 335 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CSPG5O95196 566 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 NFICP08651 508 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCNE1P24864 410 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CA8P35219 290 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 LRRC63Q05C16 580 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 ADAM9Q13443 819 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 NFIL3Q16649 462 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCDC183Q5T5S1 534 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CENPPQ6IPU0 288 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TMC7Q7Z402 723 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 USP37Q86T82 979 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TMEM174Q8WUU8 243 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 RABGGTAQ92696 567 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 DACH1Q9UI36 760 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 NUB1Q9Y5A7 615 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TRANK1O15050 2925 aa18.05■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CETN3O15182 167 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TRAPPC3O43617 180 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TNNC2P02585 160 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CLCNKBP51801 687 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CYP24A1Q07973 514 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 HYAL1Q12794 435 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CAMK1Q14012 370 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZBTB6Q15916 424 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 UPP1Q16831 310 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 SPATA1Q5VX52 437 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 KIAA1841Q6NSI8 718 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 VPS52Q8N1B4 723 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 MLKLQ8NB16 471 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 NELFBQ8WX92 580 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 IGFLR1Q9H665 355 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TLE6Q9H808 572 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 DMAC2Q9NW81 257 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 DPP3Q9NY33 737 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CACNG4Q9UBN1 327 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 EYSQ5T1H1 3165 aa18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 KIF4AO95239 1232 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 DLATP10515 647 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 KRT13P13646 458 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TNNI1P19237 187 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 DNAJB1P25685 340 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 PAK1Q13153 545 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 PSMD6Q15008 389 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZCWPW2Q504Y3 356 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 FUT10Q6P4F1 479 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 HASPINQ8TF76 798 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 TCF25Q9BQ70 676 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 MARCH5Q9NX47 278 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 MYO7AQ13402 2215 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 ANK1P16157 1881 aa18.03■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa18.02■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 MAPK13O15264 365 aa18.02■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 URODP06132 367 aa18.02■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 EPB41P11171 864 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 CD44P16070 742 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 BMP6P22004 513 aa18.02■□□□□ 0.48
SPDYE2B-201ENST00000436228 LRPAP1P30533 357 aa18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms