RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 MYL7Q01449 175 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB6Q15916 424 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 CBWD6Q4V339 395 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 KRT39Q6A163 491 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 SV2AQ7L0J3 742 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 DPP3Q9NY33 737 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 PHACTR2O75167 634 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 KRT19P08727 400 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 CYP3A5P20815 502 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 TUSC3Q13454 348 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 NAB2Q15742 525 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 UVSSAQ2YD98 709 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 ZACNQ401N2 412 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 LGALS16A8MUM7 142 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 ITGB3P05106 788 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 UBASH3AP57075 661 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 CETN1Q12798 172 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 HCSTQ9UBK5 93 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 INSL6Q9Y581 213 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1W2PPC1 479 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 TLL1O43897 1013 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 DDHD2O94830 711 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 CLSTN1O94985 981 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 PIK3CAP42336 1068 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 TRPC3Q13507 836 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 IFNKQ9P0W0 207 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1B0GTH6 734 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 P4HA2O15460 535 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
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HOXA4-202ENST00000428284 UBXN1Q04323 297 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 DSC1Q08554 894 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 B4GALT3O60512 393 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 NCOA4Q13772 614 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 TDHQ8IZJ6 230 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 UROC1Q96N76 676 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 RAD9AQ99638 391 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 GCNT4Q9P109 453 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 SIX4Q9UIU6 781 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 FSD2A1L4K1 749 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 PMM2O15305 246 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 VNN1O95497 513 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 HLA-DRAP01903 254 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 TPM3P06753 285 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 LRPAP1P30533 357 aa22.21■■□□□ 1.15
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HOXA4-202ENST00000428284 RBP5P82980 135 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 GSE1Q14687 1217 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 SARM1Q6SZW1 724 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 RABGGTAQ92696 567 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM5Q9C035 493 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA4-202ENST00000428284 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA4-202ENST00000428284 PODXLO00592 558 aa22.2■■□□□ 1.14
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