RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 CATSPER1Q8NEC5 780 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 RFWD2Q8NHY2 731 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CYGBQ8WWM9 190 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PIK3R2O00459 728 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 GYPCP04921 128 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 VCAM1P19320 739 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6V1B1P15313 513 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 INPP5DQ92835 1189 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 SENP1Q9P0U3 644 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PFASO15067 1338 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 AIM2O14862 343 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KYNUQ16719 465 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TAGAPQ8N103 731 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 BARHL2Q9NY43 387 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 BFARQ9NZS9 450 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ASAP2O43150 1006 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 NMT1P30419 496 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DPYDQ12882 1025 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 STXBP2Q15833 593 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 USP49Q70CQ1 688 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ZFATQ9P243 1243 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 SLIT1O75093 1534 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 WDR19Q8NEZ3 1342 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC78A2IDD5 438 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KCNA2P16389 499 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 HUNKP57058 714 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 NME3Q13232 169 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 STX3Q13277 289 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 OR6P1Q8NGX9 317 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 IFT43Q96FT9 208 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FLT1P17948 1338 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ANO4Q32M45 955 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 JAMLQ86YT9 394 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ADSSL1Q8N142 457 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM9Q9C026 710 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MROH2AA6NES4 1674 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KCNB1Q14721 858 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 C12orf60Q5U649 245 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 IFNEQ86WN2 208 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 RUBCNLQ9H714 662 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM247A6NEH6 219 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 H0Y626 953 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 RTN2O75298 545 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DGKIO75912 1065 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM16O95361 564 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KRT8P05787 483 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KCNJ1P48048 391 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 RBBP7Q16576 425 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF568Q3ZCX4 644 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 LOC100653049A0A140TA62 436 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KRT34O76011 436 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MYBL1P10243 752 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 GRM4Q14833 912 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC34Q8IZ02 419 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CPA5Q8WXQ8 436 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 KCNN4O15554 427 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ANXA13P27216 316 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 BLVRAP53004 296 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TEKT4Q8WW24 435 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 EGFL8Q99944 293 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FUT8Q9BYC5 575 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms