RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 LPAR1Q92633 364 aa19.93■□□□□ 0.78
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SH3BP1-202ENST00000417536 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TELO2Q9Y4R8 837 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 DENND3A2RUS2 1198 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP9AO75110 1047 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 NPTX2P47972 431 aa19.92■□□□□ 0.78
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SH3BP1-202ENST00000417536 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 HOMER3Q9NSC5 361 aa19.92■□□□□ 0.78
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SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa19.92■□□□□ 0.78
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SH3BP1-202ENST00000417536 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC39A4Q6P5W5 647 aa19.9■□□□□ 0.78
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SH3BP1-202ENST00000417536 SULF1Q8IWU6 871 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC63Q8NA47 563 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 HEMGNQ9BXL5 484 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 KMT5AQ9NQR1 393 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 DOCK5Q9H7D0 1870 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX3O60493 162 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNE2O96020 404 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 RRM1P23921 792 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 BSNDQ8WZ55 320 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 SLCO2A1Q92959 643 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF408Q9H9D4 720 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF112Q9UJU3 913 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 MROH7Q68CQ1 1323 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MGRN1O60291 552 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 IVDP26440 423 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
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SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC50Q8IVM0 306 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.775e-6■■□□□ 11.5
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SH3BP1-202ENST00000417536 TCP11Q8WWU5 503 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINB12Q96P63 405 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 RMDN3Q96TC7 470 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP350Q5VT06 3117 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 THAP12O43422 761 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCY8P40145 1251 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCY1Q08828 1119 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MCF2L2Q86YR7 1114 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MCOLN2Q8IZK6 566 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 TIPINQ9BVW5 301 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 TBK1Q9UHD2 729 aa19.89■□□□□ 0.77
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