RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 PTMSP20962 102 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CA8P35219 290 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ISM2Q6H9L7 571 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 BRSK2Q8IWQ3 736 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SPPL3Q8TCT6 385 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TLR9Q9NR96 1032 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 DERAQ9Y315 318 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 MCM4P33991 863 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 PRCPP42785 496 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SPAG1Q07617 926 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TIGD5Q53EQ6 642 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 JADE1Q6IE81 842 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TMC7Q7Z402 723 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 RDH13Q8NBN7 331 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TRAPPC3O43617 180 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 B4GALT3O60512 393 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 B3GAT3O94766 335 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 NR3C1P04150 777 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ADRB2P07550 413 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CYP3A5P20815 502 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ADGRE1Q14246 886 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 MYBPC2Q14324 1141 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 VPS52Q8N1B4 723 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 FNBP1Q96RU3 617 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TCF25Q9BQ70 676 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CXCL16Q9H2A7 254 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 C2CD2Q9Y426 696 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 MTCH2Q9Y6C9 303 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
HPS1-205ENST00000414009 PODXLO00592 558 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 NR2F2P24468 414 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CLCNKBP51801 687 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 MORC3Q14149 939 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 NAB2Q15742 525 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CEP135Q66GS9 1140 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 USP37Q86T82 979 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CBWD2Q8IUF1 395 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 RABGGTAQ92696 567 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 BICDL2A1A5D9 508 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CETN3O15182 167 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 URODP06132 367 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 NFICP08651 508 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 TNNI1P19237 187 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 LRRC63Q05C16 580 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ADAM9Q13443 819 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 UPP1Q16831 310 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 SPATA1Q5VX52 437 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 FUT10Q6P4F1 479 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ADSSL1Q8N142 457 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 GPT2Q8TD30 523 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 HASPINQ8TF76 798 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PPM1EQ8WY54 764 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 FBXL18Q96ME1 805 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms