RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLA2G4DQ86XP0 818 aa10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LMAN1LQ9HAT1 526 aa10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D13Q9NVG8 400 aa10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DPP7Q9UHL4 492 aa10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCDHA12Q9UN75 941 aa10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STK24Q9Y6E0 443 aa10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GREB1Q4ZG55 1949 aa10.48□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LAMA1P25391 3075 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BECN2A8MW95 431 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM86B1E9PN63 330 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM86B2P0C5J1 330 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGB5P18084 799 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLCG1P19174 1290 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FGFR4P22455 802 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDC25BP30305 580 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNR2P34972 360 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AFMP43652 599 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYL5Q02045 173 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPIRE1Q08AE8 756 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNB1Q14721 858 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCEAL6Q6IPX3 200 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTSS1LQ765P7 747 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NIPA1Q7RTP0 329 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AOPEPQ8N6M6 819 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC15Q8TF66 581 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FGF13Q92913 245 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCEAL3Q969E4 200 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPRASP2Q96D09 838 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CALML4Q96GE6 196 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PNMA5Q96PV4 448 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPS6KC1Q96S38 1066 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C7orf25Q9BPX7 421 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RMND1Q9NWS8 449 aa10.47□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C4orf47A7E2U8 309 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MEIS3P2A8K0S8 358 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAS2O43903 313 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 URODP06132 367 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF75DP51815 510 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AMPD3Q01432 767 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CUL4BQ13620 913 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAS6Q14393 721 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOMO2Q5JPE7 1267 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT79Q5XKE5 535 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LONP2Q86WA8 852 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PROSER1Q86XN7 944 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 METTL13Q8N6R0 699 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITFG1Q8TB96 612 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HSD3B7Q9H2F3 369 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC9A2Q9UBY0 812 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLK13Q9UKR3 277 aa10.46□□□□□ -0.73
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TENM4Q6N022 2769 aa10.46□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EVPLQ92817 2033 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MEIS1O00470 390 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MSH4O15457 936 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TGM5O43548 720 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLRC4O43908 158 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HBP1O60381 514 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DDHD2O94830 711 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHOBTB3O94955 611 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAPLNO95428 1278 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRB1P04280 392 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPN1P04843 607 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACTR2P61160 394 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TPM4P67936 248 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SETQ01105 290 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTMR1Q13613 665 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEP55Q53EZ4 464 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COBLL1Q53SF7 1204 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRR16Q569H4 304 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNX29Q8TEQ0 813 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAD54LQ92698 747 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC5A5Q92911 643 aa10.45□□□□□ -0.74
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDHR1Q96JP9 859 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms