RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376152.2

PRAMEF15-201, Transcript of PRAME family member 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF15, Length 1,865 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF15-201ENST00000376152 MTF1Q14872 753 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 FBXO47Q5MNV8 452 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TRAF7Q6Q0C0 670 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 RAD9BQ6WBX8 426 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CCDC91Q7Z6B0 441 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 GPIHBP1Q8IV16 184 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 DEF6Q9H4E7 631 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 RAB20Q9NX57 234 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 APEX2Q9UBZ4 518 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CEP83Q9Y592 693 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 MROH7Q68CQ1 1323 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CITO14578 2027 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 ARHGAP6O43182 974 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 NRDCO43847 1150 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CAND2O75155 1236 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 HLA-DRAP01903 254 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CCDC172P0C7W6 258 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CKBP12277 381 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 GJA8P48165 433 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 LPIN1Q14693 890 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TMTC1Q8IUR5 882 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 FAM126BQ8IXS8 530 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 MNS1Q8NEH6 495 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 ELMO3Q96BJ8 720 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 ACAP3Q96P50 834 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 HTATIP2Q9BUP3 242 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 MTMR12Q9C0I1 747 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CXCL16Q9H2A7 254 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 ERVK-5Q9HDB9 667 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 SNTG2Q9NY99 539 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 HES2Q9Y543 173 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CD4P01730 458 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TFRCP02786 760 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 NFICP08651 508 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 GHRP10912 638 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CD52P31358 61 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 AP3M2P53677 418 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CDK17Q00537 523 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 BIRC3Q13489 604 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 RAPGEF1Q13905 1077 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 DUOXA2Q1HG44 320 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 SFMBT2Q5VUG0 894 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 JADE1Q6IE81 842 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CYP26C1Q6V0L0 522 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 PI4K2AQ9BTU6 479 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 STK33Q9BYT3 514 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 GPR88Q9GZN0 384 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 ASB7Q9H672 318 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 AIPL1Q9NZN9 384 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 MYO6Q9UM54 1294 aa12□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TRIP11Q15643 1979 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 GPR182O15218 404 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CST3P01034 146 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 PIK3CAP42336 1068 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 KCNJ6P48051 423 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 HGSNATQ68CP4 663 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TMEM130Q8N3G9 435 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 HELQQ8TDG4 1101 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 KAT5Q92993 513 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TATDN2Q93075 761 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 SPAG5Q96R06 1193 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 RNF39Q9H2S5 420 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 PADI3Q9ULW8 664 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 F8VZ95 297 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 PHACTR2O75167 634 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 RFX1P22670 979 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 MBTPS1Q14703 1052 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 ALKAL1Q6UXT8 129 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 ZBTB9Q96C00 473 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAMEF15-201ENST00000376152 SNX27Q96L92 541 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms